باباطاهر هم گیاهخوار بود.

به همین دلیل عده ای معتقدند که او مانوی مسلک هم بوده است.این تردید از آنجا شروع می شود که باباطاهر را متهم به زندیق بودن می کرده اند و در آن زمان به مزدکیان و مانوویان زندیق می گفته اند. زیرا که این را سمعانی نقل کرده است که بابا طاهر به زندیقی متهم بوده است.البته تردیدهایی هم هست.زیرا اتهام زندیق را در آن زمان به بعضی اندیشمندان مسلمان هم بسته اند.

البته در مورد گیاهخواری بابا طاهر و حتی گچ کاری او شکی نیست و همین دو موضوع شک به مانووی بودن او را افزون می کند.